Pulmonal sepsis forløber næsten på samme måde som septikæmi, men lungerne er involveret i processen, og der udvikles overvejende fokal purulent betændelse af alveolitis-typen. En vigtig forskel mellem den pulmonale form for sepsis og septikæmi er en signifikant stigning i kropstemperatur, hovedpine, takykardi, hypotension