Sulfoesteraser er enzymer, der katalyserer hydrolysen af sulfoesterbindinger. De tilhører gruppen af sulfataser og spiller en vigtig rolle i metabolismen af sulfaterede biomolekyler såsom glycosaminoglycaner, glycolipider og steroider.
Sulfoesteraser er vidt udbredt i mennesker og andre pattedyr. De er lokaliseret i lysosomer, endoplasmatisk retikulum og Golgi-apparat. Forstyrrelser i disse enzymers funktion fører til udviklingen af en række arvelige sygdomme forbundet med ophobning af unedbrudte sulfaterede substrater.
Studiet af sulfoesteraser er af stor betydning for forståelsen af mekanismerne for katabolisme af sulfaterede forbindelser og udvikling af metoder til behandling af arvelige forstyrrelser i deres stofskifte.