La arteria pterigoidea es una rama de la arteria carótida externa y suministra sangre a la región temporomandibular, la apófisis mastoides, el músculo temporal, los músculos de la lengua, la faringe y la laringe. En los adultos se sitúa en el hueco de la entrada rocosa y acompaña a la cavidad del nido de piedra, en los niños es ligeramente más bajo. Sale del canal a través del tronco arterial común junto con el nervio y la membrana mucosa. La parte móvil de la barra transversal ingresa a la fosa infratemporal. Troncos a. pterygoidea anterio et posterus divergen y se unen en un ángulo de aproximadamente 20° detrás de la mandíbula en la arteria facial.
La arteria del canal pterigoideo participa en el suministro de sangre a varias áreas anatómicas importantes de la cabeza, como la parte lateral del cráneo, la parótida, las cavidades palatina mayor y palatina menor, el hueso hioides, la cavidad bucal, la orofaringe y las trompas de Eustaquio.