Korkeaa kystotomiaa kutsutaan yleensä leikkaukseksi, jonka aikana virtsarakon seinämä paljastetaan kirurgisella kudosleikkauksella, mutta itse sen seinämiä ei leikata, eli virtsarakon katetrointia ei tehdä. Kystotomin avulla ei tehdä täyttä, vaan puolikuun muotoista viiltoa (koska sen seinän kaikki kerrokset yhtyvät virtsarakon kehää pitkin). Rakko on poikittain auki ja vapaa tarkastettavaksi.
Useimmiten tällaiset kirurgiset toimenpiteet suoritetaan intrakavitaarisella optisella tai uretrovesical menetelmällä.
Leikkauksen päätyttyä potilas pysyy sairaalassa 5-7 päivää, jossa hänelle suoritetaan toipumisjakso. Jos elimen seinämän ulkokerrosten lisäksi myös syvempiä kudoksia leikataan, on olemassa suuri verenhukan, infektioiden ja haavakomplikaatioiden riski (lyijyhaavojen muodostuminen, nefroskleroosi jne.) ja adheesiot.