Biegunka z niedoboru witamin jest dość rzadką chorobą spowodowaną brakiem składników odżywczych (witaminy) lub ich całkowitym brakiem w organizmie. W wyniku niedostatecznego odżywienia lub niedoboru witaminy przez organizm, nawet jeśli nie zaobserwowano wyraźnych objawów niedoboru witaminy, mogą rozpocząć się niedobory witamin w żołądku i jelitach. Zazwyczaj taki objaw wskazuje na brak kilku witamin jednocześnie, co może być albo kliniczną manifestacją choroby, albo niezależnym zaburzeniem metabolicznym i niedoborem witamin. Do najczęstszych niedoborów witamin w przewodzie pokarmowym zalicza się kseroftalmię, krzywicę i chorobę Graya.
Biegunka z niedoboru witamin jest bardzo niebezpiecznym objawem niedoboru witamin. Brak niezbędnych witamin w organizmie może skutkować wyczerpaniem układu nerwowego - osłabieniem, apatią, utratą masy mięśniowej, utratą pamięci, zaburzeniami psychicznymi, zaburzeniami pracy mózgu i narządów wzroku. Niedobór niektórych witamin może utrzymywać się dość długo bez objawów klinicznych, aż do momentu pojawienia się jego pierwszych wyraźnych negatywnych konsekwencji w postaci biegunki.