Istnieją bakterie, które powodują gnicie, a w obecności takich bakterii w jelitach zaczynają dominować mikroorganizmy oportunistyczne, a te „użyteczne” faktycznie znikają. W rezultacie pojawia się dysbioza i rozwijają się procesy zapalne o różnym nasileniu. Bezpośrednio zaangażowane są w to enzymy lub laktaza