Zakażenia ortomyksowirusami to grupa chorób o dość szerokim spektrum działania, od wysoce zakaźnych po mało patogenne. Czynniki wywołujące te infekcje są zwykle klasyfikowane jako wirusy RNA o średnicy 70 - 400 nm. Jednocześnie wielkość i układ szczegółów strukturalnych tych wirusów są na tyle zróżnicowane, że pracujący z nimi specjaliści mogą zrozumieć, że jest to grupa patogenów tego samego typu.
Czynniki wywołujące zakażenia ortomyksowirusami zwykle namnażają się w komórkach we wczesnych stadiach rozwoju. Prowokatorzy pierwszej, szybko rozwijającej się ostrej postaci choroby pokonują bariery komórkowe i gromadzą się w cytoplazmie. Warunkiem przejścia od początkowego stadium choroby jest wprowadzenie wirusa do enterocytów, komórek nabłonkowych dróg oddechowych i hepatocytów. Wirusy przez pewien czas potrafią aktywnie się namnażać, po czym przedostają się do bardziej odległych obszarów narządów, a powstająca choroba postępuje. W międzyczasie infekcja może przejść z jednego żywiciela na drugiego. Ponieważ wirusy zawierają antygeny identyczne z białkami ludzkimi lub ssaczymi, są one szybko rozpoznawane i indukowane są reakcje immunologiczne. Po szybkim początku choroby odpowiedź immunologiczna słabnie wraz ze spadkiem stężenia wirusa w krwiobiegu. Pomimo częściowej apeptii antygenów wirusowych na skutek osłabienia odpowiedzi immunologicznej i stabilności interferonów, całkowite oczyszczenie organizmu z inwazji wirusa możliwe jest dopiero po osiągnięciu fazy zdrowienia. Zakończenie choroby zwykle następuje na tle aktywacji układu odpornościowego w celu uzupełnienia zlokalizowanych objawów choroby.