Carga de mutação é um termo frequentemente usado em genética e biologia evolutiva para se referir à complexidade e intensidade dos eventos de mutação que ocorrem em uma população. Este termo pode ser usado tanto para descrever a carga adaptativa, ou seja, o potencial evolutivo de um determinado genótipo, quanto para descrever uma mutação de estresse que pode levar à perturbação da estabilidade do sistema genético.
Ao considerar a carga mutacional adaptativa, o termo refere-se à complexidade resultante da presença de múltiplas mutações por unidade de tempo. Isto enfatiza a necessidade de otimizar os sistemas genéticos, uma vez que cada mutação eleva o potencial de sobrevivência do organismo a um novo nível e também cria o potencial para mutações em outros genes.