Pulmoner sepsis, septisemi ile hemen hemen aynı şekilde ilerler, ancak sürece akciğerler dahil olur ve ağırlıklı olarak alveolit tipinde fokal pürülan inflamasyon gelişir. Pulmoner sepsis ve septisemi arasındaki önemli bir fark, vücut ısısında, baş ağrılarında, taşikardide, hipotansiyonda önemli bir artıştır.