La cromatina sessuale maschile è costituita da molecole di DNA concentrate nella regione dell'eterocromatina del cromosoma Y maschile. Viene anche chiamata "cromatina Y". Per quanto riguarda l'i-cromotempo possiamo dire che si trova al centro, su grandi gruppi di DNA, che di solito si trovano tra due centromeri adiacenti (regioni contenenti i centromeri dei cromosomi).
Quando la struttura del tipo sessuale maschile della cromatina y (cromatina Y) risiede quindi nella sua unicità
La cromatina riproduttiva maschile è un segmento di uno dei due cromosomi X omologhi (identici) che determina il normale sviluppo del sistema riproduttivo maschile (ovviamente, adattato per l'azione di altri geni che codificano vari aspetti di cellule e tessuti genotipicamente diversi).