Liên hợp khoảng cách—C., kèm theo sự hình thành các điểm thắt giữa các nhiễm sắc thể của hai nhiễm sắc thể tương đồng riêng biệt. Sự co thắt giữa các nhiễm sắc thể là kết quả của sự phát triển không đồng đều của nhiễm sắc thể trong giai đoạn xen kẽ của nhiễm sắc thể tập thể dục. Trong chu kỳ tế bào bình thường, liên kết nhân luôn hiện diện (ngoại trừ các giai đoạn của pha S), và do sự tiếp xúc này, sự phiên mã các gen của một số nhiễm sắc thể và sự sao chép DNA của phần xen kẽ của nhiễm sắc thể xảy ra với các nhánh gen chồng lên vùng tiếp xúc
Kiểu liên hợp này được quan sát thấy ở sinh vật nhân chuẩn. Tuy nhiên, điều quan trọng cần lưu ý là việc chuyển hoặc trao đổi các phần nhiễm sắc thể không phải lúc nào cũng xảy ra trong kỳ giữa. Đôi khi, trong quá trình phát triển và phân chia tế bào, xảy ra sự vận chuyển tích cực các vùng nhiễm sắc thể tương ứng, nơi có tập hợp trình tự nucleotide tương ứng có khả năng biểu hiện gen. Việc chuyển các phần DNA từ nhiễm sắc thể này sang nhiễm sắc thể khác như vậy có thể xảy ra cả trong giai đoạn hình thành nhiễm sắc thể chị em và trong giai đoạn xen kẽ, có thể xảy ra cả hai cùng một lúc.
Cuối cùng, sự liên hợp và lai chéo là những quá trình quan trọng trong quá trình sao chép và giải trình tự gen. Nguyên phân, đã thảo luận trước đó, cũng bao gồm sự liên hợp và trao đổi chéo, cần thiết để có được một bản sao nhiễm sắc thể giống hệt nhau và chuẩn bị cho sự hình thành
Liên hợp khoảng cách là một kiểu sắp xếp lại nhiễm sắc thể, bao gồm thực tế là hai nhiễm sắc thể được kết nối bằng cách gắn đứt, mà không rơi vào cùng một đoạn nhiễm sắc thể. Với sự sắp xếp lại này, các nhiễm sắc thể sẽ di chuyển ra xa nhau ở một khoảng cách nhất định. Kỹ thuật này còn được gọi là “điều khiển từ xa