Postvakcinační myokarditida se obvykle nazývá zánětlivý proces myokardu, který vzniká po očkování. Myokard je výstelka srdce. Nemůže se stáhnout, protože dojde k poškození v oblasti, která ovládá tuto funkci. Když se kardiomyocyty (svalové buňky, které tvoří srdce) tímto způsobem zanítí v důsledku infekcí, environmentálních toxinů nebo chemikálií, dochází k tomu, co se nazývá primární postvakcinační myokarditida. Zde hovoříme o postkardiální polékové myokarditidě.
S pomocí a pod vlivem vakcín je stimulován imunitní systém, který spouští proces tvorby specifických protilátek. Dochází k imunitní reakci. Když imunitní systém napadne buňky srdečního masového těla, některé svalové buňky jsou poškozeny nebo zabity. U osob s potlačeným imunitním systémem, například po ozáření