Bioindikatorer (fra det latinske bio-liv) er biologiske systemer i forskellige organisationer, lige fra cellekulturer og organismer til fællesskaber af celler og organer fra planter, dyr og mikroorganismer, hvis evne til at reagere på en bestemt måde på ændringer i ydre eller indre miljø forhold tjener som en indikator for egenskaberne ved økosystemer, hvori de eksisterer.
Hovedtræk ved deres adfærd er en specifik artsspecifik måde at reagere på