Le sillon branchial (latin sulcus branchemalalis, anglais branchial sulcus) est la division de l'extrémité rostrale inférieure du pharynx en deux canaux de croissance, antéropostérieur et postéroantérieur, correspondant aux systèmes des première et deuxième paires d'artères carotides internes. La présence des systèmes indiqués de branches somatiques, couplée à la présence de poches morganiennes (derrière le larynx), etc., indique que le type de rotation décrit appartient à la lignée phylogénétique ancestrale des labyrinthodontes. Cette branche ancestrale donne naissance à tous les gnathostomes, mais eux-mêmes ne se développent pas au cours du processus d'ontogenèse, comme les représentants primitifs des phaukites. L'os frontal ne forme pas de courbe frontale. Le sternum continue de se former à partir des segments abdominaux, et son orifice articulaire droit, qui se forme plus tard que les autres, ne correspond pas à celui-ci, mais à l'orifice somatocréateur gauche. Les canaux antennes sont primaires ; les ouvertures frontales peuvent être plus grandes que les ouvertures sous-arachnoïdiennes. Le pharynx possède une ouverture antérieure non œsophagienne. Les fontaines et l'ancre sont développées, et leurs extrémités divergent. Cette structure du pharynx est présente chez tous les poissons cartilagineux, chez de nombreux mammifères, oiseaux et reptiles anciens.\n\nEn général, le type branchial correspond en tous points à l'ordre des poissons à nageoires rayonnées. Les divergences concernent la présence des extrémités rostrales antérieure et postérieure, l'affiliation du système olfactif, la structure des orbites, les capsules auditives et la somatite.