Lapisan Waldeyer adalah lapisan sel otak kecil yang dijelaskan oleh ahli anatomi Jerman Wilhelm Waldeyer pada akhir abad ke-19.
Otak kecil terdiri dari tiga lapisan sel - molekuler, granular dan Purkinje. Lapisan molekuler sebagian besar terdiri dari sel bintang dan sel keranjang. Lapisan granular mengandung sel granular. Lapisan Purkinje terdiri dari sel-sel Purkinje besar yang terletak di antara lapisan molekuler dan granular.
Waldeyer menjelaskan lokasi dan struktur ketiga lapisan sel otak kecil ini. Ia juga pertama kali mengemukakan bahwa sel Purkinje adalah sel pengolah informasi utama di otak kecil. Lapisan sel otak kecil sekarang dinamai Waldeyer sebagai "lapisan Waldeyer". Mereka memainkan peran penting dalam mengkoordinasikan gerakan dan menjaga keseimbangan.