Kodon
Kodon hüceyrələrdə replikasiya və genlərin tənzimlənməsi prosesində iştirak edən kiçik bir DNT parçasıdır. Bununla belə, DNT-nin bəzi hissələri bədən üçün faydasız və hətta zərərli ola bilər. Bu bölgələrə cəfəngiyyat və ya cəfəng kodlaşdırma kodları deyilir.
Belə kodonlar zülalları kodlamır, əksinə transkripsiya və tərcüməni tənzimləmək kimi müxtəlif funksiyaları yerinə yetirir. Onlar həmçinin genomun redaktəsi və polimeraza zəncirvari reaksiya proseslərində iştirak edə bilərlər.
Cəfəngiyat kodonları genomun müxtəlif bölgələrində, o cümlədən kodlaşdırılmayan bölgələrdə, genlərarası boşluqlarda və erkən transkripsiyanın başlanğıcında baş verir. Cəfəngiyat ardıcıllığı tez-tez ribozim antikodonları, metiltransferazlar və digər dəyişdirici zülallarla əlaqələndirilir.
Cəfəngiyyat kodonlarının bəzi nümunələrinə tərcümə dayanacaqları olan UAG, UAU, UGA və tərcüməyə heç bir təsiri olmayan cəfəng intron kodonları (GU kimi) daxildir.
Cəfəngiyat kodonlarının əhəmiyyəti
Mənasız və ya mənasız kodonların rolu onların transkripsiya, tərcümə və gen tənzimləmə proseslərinə təsir göstərmək qabiliyyətindən ibarətdir. Bu kodonlar gen ifadəsini modullaşdıra, alternativ transkripsiyanın başlanğıcını dəyişdirə və transkripsiya tənzimləyiciləri ilə qarşılıqlı əlaqədə ola bilər. Ardıcıllıqdan asılı olaraq, cəfəngiyat kodonları da müxtəlif növ RNT ifadə edə bilər və alternativ birləşməyə təsir göstərə bilər.
Cəfəngiyat kodonları embrionun inkişafı proseslərində mühüm rol oynayır və suprastatik reaksiyalarda və sinir toxumasında gen ifadəsi və transkripsiyasına nəzarətdə iştirak edə bilər. Cəfəngiyat kodlaşdırma ardıcıllığı da tənzimləyici elementlərin ifadəsini dəyişdirə və çoxlu genin kəmiyyət və keyfiyyət ifadəsinə təsir göstərə bilər. Məsələn, onlar sinir hüceyrələrinin tropizmini təyin edə, iltihabi proseslərdə aktivləşə və karyotipə xas ifadəyə səbəb ola bilərlər.
Bundan əlavə, bəzi tədqiqatçılar cəfəngiyat RNT kodlarının toxumalara xas ifadənin tənzimlənməsində əsas rol oynadığını irəli sürdülər. Bəzi müəlliflər DNT anormallıqları üçün molekulyar erkən xəbərdarlıq sistemi kimi mənasız DNT fraqmentlərindən istifadənin mümkünlüyünə işarə edirlər. Cəfəngiyatsız DNT fraqmenti ekzotik yapışqan DNT-nin çevrilməsindən sonra səhv təmir prosesini başlada bilər.
Məntiqsiz DNT analizi
Kodonları cəfəngiyyat kimi xarakterizə etmək və təsnif etmək üçün bütün genomun və ya gen transkriptinin ardıcıllığını təhlil etmək və DNT bölgəsinin cəfəngiyyat və ya lazımsız olduğunu söyləmək üçün təkrarlanan və ya qorunan ardıcıllığı tapmaq lazımdır. Belə bir dublikat bölgənin funksiyasını qurmaq üçün onun sintezi və ardıcıllığı tələb olunur, sonra gen və bu bölgə ilə əlaqəli digər genlərlə korrelyasiya aparılır, bu gen tərəfindən kodlanan zülalın ifadəsi öyrənilir,
Cəfəngiyyat kodonu genetik tədqiqat və təcrübələrdə ən çox istifadə edilən genetik kod növlərindən biridir. Adi zülal kodlayan genlərdən fərqli olaraq, bu kodonlar mənasız və bədən üçün faydasızdır.
Ancaq bu kodonlar yararsız olsalar da, canlı orqanizmlərdə hələ də mühüm rol oynayırlar. Hüceyrələrə öz funksiyalarını idarə etməyə və inkişaf prosesini idarə etməyə kömək edirlər. Bundan əlavə, cəfəng kodonlar genomikada kəsilmə nöqtələri kimi istifadə olunur ki, bu da alimlərə DNT-nin xüsusi bölmələrini dəqiq müəyyən etməyə imkan verir.
Cəfəngiyat kodonları daun sindromu kimi bəzi xəstəliklərlə də əlaqələndirilir