Codon
Kodon je malý kousek DNA, který se účastní procesu replikace a genové regulace v buňkách. Některé úseky DNA však mohou být pro tělo zbytečné nebo dokonce škodlivé. Tyto oblasti se nazývají nesmyslné nebo nesmyslné kódující kodony.
Takové kodony nekódují proteiny, ale místo toho vykonávají různé funkce, jako je regulace transkripce a translace. Mohou se také podílet na editaci genomu a procesech polymerázové řetězové reakce.
Nesmyslné kodony se vyskytují v různých oblastech genomu, včetně nekódujících oblastí, intergenových prostorů a časných začátků transkripce. Nesmyslné sekvence jsou často spojeny s ribozymovými antikodony, methyltransferázami a dalšími modifikačními proteiny.
Některé příklady nesmyslných kodonů zahrnují UAG, UAU, UGA, což jsou translační zastávky, a nesmyslné intronové kodony (jako je GU), které nemají žádný vliv na translaci.
Význam nesmyslných kodonů
Role nesmyslných nebo nesmyslných kodonů spočívá v jejich schopnosti ovlivňovat procesy transkripce, translace a genové regulace. Tyto kodony mohou modulovat genovou expresi, modifikovat alternativní začátky transkripce a interagovat s regulátory transkripce. V závislosti na sekvenci mohou nesmyslné kodony také exprimovat různé typy RNA a ovlivnit alternativní sestřih.
Nesmyslné kodony hrají důležitou roli v procesech embryonálního vývoje a mohou se podílet na suprastatických reakcích a řízení genové exprese a transkripce v nervové tkáni. Nesmyslné kódující sekvence mohou také změnit expresi regulačních prvků a ovlivnit kvantitativní a kvalitativní expresi více genů. Mohou například určovat tropismus nervových buněk, být aktivovány při zánětlivých procesech a způsobit karyotypově specifickou expresi.
Kromě toho někteří výzkumníci navrhli, že nesmyslné kódy RNA hrají klíčovou roli v regulaci tkáňově specifické exprese. Někteří autoři poukazují na možnost využití nesmyslných fragmentů DNA jako molekulárního systému včasného varování před abnormalitami DNA. Nesmyslný fragment DNA může zahájit proces opravy chyb po transformaci exotické adhezivní DNA.
Nesmyslná analýza DNA
Abychom charakterizovali a klasifikovali kodony jako nesmyslné, je nutné analyzovat sekvenci celého genomu nebo genového transkriptu a najít opakovanou nebo konzervovanou sekvenci, která naznačuje, že oblast DNA je nesmyslná nebo nadbytečná. Pro stanovení funkce takové duplicitní oblasti je nutná její syntéza a sekvenování, poté se provede korelace s genem a dalšími geny asociovanými s touto oblastí, studuje se exprese proteinu kódovaného tímto genem,
Nesmyslový kodon je jedním z typů genetického kódu, který se nejčastěji používá v genetickém výzkumu a experimentech. Na rozdíl od běžných genů kódujících proteiny jsou tyto kodony bezvýznamné a pro tělo zbytečné.
Nicméně, i když jsou tyto kodony k ničemu, stále hrají důležitou roli v živých organismech. Pomáhají buňkám řídit jejich funkce a řídit proces vývoje. Kromě toho se nesmyslné kodony používají jako body zlomu v genomice, což vědcům umožňuje přesně identifikovat konkrétní úseky DNA.
Nesmyslné kodony jsou také spojovány s některými nemocemi, jako je Downův syndrom