Potentielle alleler er de par af genetiske varianter, der kan producere afkom på grund af en kompenserende mutation. Baseret på materialet af fire loci (hæmoglobiner 1, hypoxisk hypoxi 2, seglcelleanæmi 3, fructosamin 4) blev det vist, at de kan erstatte den normale form med en anden form på grund af inverter-gener og komplementære gener, hvoraf sidstnævnte involverer mutationer af de samme gener for forskellige typer af komplementering. Disse repræsentanter er således ikke blot mindre mutanter i den forstand, at deres forsvinden fra befolkningen kun har ringe forstyrrelse