Potenciální alely jsou ty páry genetických variant, které mohou produkovat potomstvo díky kompenzační mutaci. Na základě materiálu čtyř lokusů (hemoglobiny 1, hypoxická hypoxie 2, srpkovitá anémie 3, fruktosamin 4) bylo prokázáno, že mohou nahradit normální formu jinou formou díky invertorovým genům a komplementárním genům, z nichž druhý zahrnuje mutace stejných genů pro různé typy komplementace. Tito zástupci tedy nejsou pouhými menšími mutanty v tom smyslu, že jejich zmizení z populace jen málo naruší