En bakteriel biocenose er et jordafsnit, hvor bakterier er i balance med andre mikroorganismer og har gensidig indflydelse på hinanden, på planter og dyr. Dette miljø har normalt karakteristika af klima, topografi, jordbund samt forstyrrede økosystemer. Bakterier er en af de vigtigste komponenter i skovens organisme; de danner ikke kun et substrat for planter, men deltager også i de grundlæggende processer af fotosyntese, respiration, humusdannelse og spiller også en nøglerolle i væksten af trærødder. Derudover spiller bakterier en væsentlig rolle i dannelsen af jord, som er en uundværlig ressource for planters og skovareters liv. Derfor kan ændringer i den bakterielle biocenose have en væsentlig indflydelse på skovbiotaens livsmiljø.
Bakteriel biocenose er et fællesskab af levende organismer: bakterier og svampe. Evolutionært relativt ung for biosfæren som et separat objekt for menneskelig indflydelse. Mikrobiocenoser findes i jord og vand. Hvis økosystemet fungerer normalt, så stabiliserer bakterier det - de fungerer som heterotrofer i stoffernes kredsløb. Det er bakterier, der er aktivt involveret i kulstofkredsløbet og omdanner simple former for organiske forbindelser til komplekse. Kulstofoverførsel i cellen udføres kun af autotrofe organismer. Og på globalt plan bæres det af heterotrofer, der også oxiderer store mængder nitrogen. Og alle forfaldsprocesser i jord og organismers celler er resultatet af aktiviteten af bakterielle heterotrofer.