Eine bakterielle Biozönose ist ein Bodenabschnitt, in dem Bakterien im Gleichgewicht mit anderen Mikroorganismen stehen und sich gegenseitig, auf Pflanzen und Tiere, beeinflussen. Diese Umgebung weist normalerweise Merkmale des Klimas, der Topographie, des Bodens sowie gestörter Ökosysteme auf. Bakterien sind einer der wichtigsten Bestandteile des Waldorganismus; sie bilden nicht nur ein Substrat für Pflanzen, sondern sind auch an den Grundprozessen der Photosynthese, Atmung und Humusbildung beteiligt und spielen auch eine Schlüsselrolle beim Wachstum der Baumwurzeln. Darüber hinaus spielen Bakterien eine wichtige Rolle bei der Bildung des Bodens, der eine unverzichtbare Ressource für das Leben von Pflanzen und Waldarten darstellt. Daher können Veränderungen in der bakteriellen Biozönose erhebliche Auswirkungen auf das Lebensumfeld von Waldbiota haben.
Die bakterielle Biozönose ist eine Gemeinschaft lebender Organismen: Bakterien und Pilze. Evolutionär relativ jung für die Biosphäre als eigenständiges Objekt menschlichen Einflusses. Mikrobiozönosen kommen im Boden und im Wasser vor. Wenn das Ökosystem normal funktioniert, stabilisieren Bakterien es – sie fungieren als Heterotrophe im Stoffkreislauf. Es sind Bakterien, die aktiv am Kohlenstoffkreislauf beteiligt sind und einfache Formen organischer Verbindungen in komplexe umwandeln. Der Kohlenstofftransport innerhalb der Zelle erfolgt nur durch autotrophe Organismen. Und im globalen Maßstab wird es von Heterotrophen übertragen, die ebenfalls große Mengen Stickstoff oxidieren. Und alle Zerfallsprozesse in Böden und Zellen von Organismen sind das Ergebnis der Aktivität bakterieller Heterotropher.