Allelgener er to eller flere kopier af et gen placeret på det samme kromosom. De kan være identiske eller forskellige, hvilket resulterer i forskellige fænotyper i organismer. Allelgener koder for forskellige proteiner eller påvirker andre geners aktivitet, hvilket kan føre til forskellige træk og egenskaber ved organismen.
Allelgener kan være dominerende eller recessive, afhængigt af hvilke af dem der vil blive udtrykt i kroppens celler. Dominante gener bestemmer normalt synlige træk, såsom hud-, hår- eller øjenfarve, mens recessive gener påvirker skjulte træk, der ikke er synlige udefra.
Nogle allele gener er vigtige for kroppens sundhed, for eksempel gener forbundet med modtagelighed for visse sygdomme. Andre allele gener er mindre vigtige, men kan påvirke udseendet af organismen eller dens adfærd.
For at bestemme allelgener bruges genetiske tests til at bestemme, hvilke alleler der er til stede i det menneskelige genom. Dette kan være nyttigt til at identificere arvelige sygdomme eller dispositioner for dem, såvel som til at bestemme kompatibilitet ved udvælgelse af par til undfangelse.