Αυτό που συμβαίνει αρκετά συχνά, η αιτία ασθενειών με τη μορφή αλλεργιών είναι ένας τεράστιος αριθμός διαφορετικών ιών (μικροοργανισμών) που επηρεάζουν το ανοσοποιητικό σύστημα του σώματος. Η εξάπλωση ιογενών και βακτηριακών λοιμώξεων επηρεάζει την ανάπτυξη αλλεργικής αντίδρασης. Τα βακτήρια και οι ιοί φτάνουν στα ανώτερα στρώματα της αναπνευστικής οδού, γεγονός που προκαλεί και μειώνει την προστασία από ασθένειες και διάφορες επιθέσεις που μπορούν να προκαλέσουν αλλεργίες ακόμη και σε ένα υγιές άτομο. Μια μη φυσιολογική αντίδραση υπερευαισθησίας εκδηλώνεται με διάφορους τρόπους, όπως οίδημα ή αναφυλαξία μαλακών ιστών, διαταραχές του ανοσοποιητικού συστήματος, ιογενείς λοιμώξεις ή μειωμένη άμυνα. Μια συγκεκριμένη ασθένεια μπορεί να πάρει τη μορφή αλλεργίας όταν ένας ιός διαταράσσει το ανοσοποιητικό σύστημα. Οι διαδικασίες μετά τη μόλυνση μιας λοίμωξης μπορεί να διαρκέσουν πολύ και μερικές φορές να προκαλέσουν αλλεργική αντίδραση.