Η απαέρωση των φυσικών δεξαμενών (φύση) είναι η διαδικασία καθαρισμού του νερού από τα αέρια που περιέχει, ιδιαίτερα το υδρόθειο, το διοξείδιο του άνθρακα και το μεθάνιο. Εμφανίζεται σε διάφορους τύπους υδάτινων μαζών, συμπεριλαμβανομένων των ωκεανών, των θαλασσών και των ποταμών. Αυτή η διαδικασία είναι μια φυσική μορφή αυτοκαθαρισμού του νερού στη φύση. Η απαέρωση συμβάλλει στη βελτίωση της ποιότητας του νερού, η οποία έχει θετική επίδραση στην ανθρώπινη υγεία και στο περιβάλλον.
Η φυσική απαέρωση των υδάτινων σωμάτων συμβαίνει λόγω της οξείδωσης οργανικών ενώσεων υπό την επίδραση του οξυγόνου που παρέχεται με τον αέρα