Homonomie is een term die in de biologie wordt gebruikt om een groep verwante organismen te beschrijven die vergelijkbare kenmerken en eigenschappen hebben. Homonomen zijn genen of sets genen die dezelfde functies in een organisme reguleren. Ze kunnen zowel nuttig als schadelijk zijn voor het lichaam.
Homonomieën kunnen verschillend zijn. Mensen hebben bijvoorbeeld verschillende soorten heemgenen en gengenen. Hemognomen bepalen de vorm van bloedcellen, en genogenen controleren de groei en ontwikkeling van het lichaam.