Ploïdie is het aantal identieke of vergelijkbare sets chromosomen in een cel.
Ploïdie bepaalt het aantal chromosomen in een cel. Bij de meeste soorten zijn somatische weefselcellen diploïde, dat wil zeggen dat ze twee sets chromosomen bevatten. Cellen met één set chromosomen (bijvoorbeeld geslachtscellen) worden haploïde genoemd.
Polyploïdie is de aanwezigheid van meer dan twee sets chromosomen. Er zijn triploïdie (3 sets), tetraploïdie (4 sets), enz. Polyploïde cellen worden vaak aangetroffen in planten.
Bij mensen is de normale ploïdie van somatische cellen 2n (diploïde). Afwijkingen van ploïdie leiden tot ernstige ontwikkelingsstoornissen. Het syndroom van Down wordt bijvoorbeeld geassocieerd met de aanwezigheid van een extra chromosoom (trisomie).
Ploïdie is dus een belangrijk kenmerk van een cel, dat het aantal chromosomen bepaalt en de ontwikkeling van het organisme beïnvloedt. Veranderingen in ploïdie leiden vaak tot pathologische aandoeningen.