Biegun embrionalny to termin używany w embriologii i biotechnologii do określenia punktu rozwoju, który znajduje się pomiędzy blastocystą a przyczepem do endometrium. To miejsce jest punktem wyjścia do prawidłowego funkcjonowania zarodka i rozwoju ciąży. Blastocysta osiąga biegun ambryalny kilka dni po zapłodnieniu, następnie rozwija się szybko i dociera do jamy macicy przed implantacją.
Według niektórych naukowców biegun ambryalny zajmuje szczególne miejsce w rozwoju zygoty i wiąże się z pewnymi ważnymi procesami, takimi jak regulacja kształtu i wielkości blastuli. Na przykład ataksja blastomerów na biegunie ambralnym może wpływać na tworzenie dwustronnej symetrii blastury, co z kolei wpływa na jej wielkość i kształt. Podobnie mutacje na tym poziomie mogą prowadzić do nieprawidłowości i opóźnień w rozwoju embrionalnym.
Znaczenie okolicy amemryalnej dla pomyślnego rozwoju zarodka nie ogranicza się tylko do zmian w kształcie blastuli, ale wiąże się także z innymi ważnymi procesami. W szczególności obecność cząsteczek typu retiluminum i kationowych na komórkach ambebralnych może odgrywać ważną rolę w produkcji i przechowywaniu żółtka, a także regulować ruch komórek w wieku dorosłym. Ogólnie rzecz biorąc, badanie procesów zarodkowych pozwala lepiej zrozumieć rozwój zarodków i może być stosowane w biotechnologii, biologii molekularnej, genetyce i położnictwie.