Endo är en japansk skola för bakteriologi, en riktning inom mikrobiologi. Namnet ges för att hedra den japanske bakteriologen Tohtaro Endo (1868-1952), skaparen av Endo-mediet för att odla mikroorganismer. Termen "endo-" används också för att beskriva vissa egenskaper hos mikroorganismer som inducerar tillväxten av en organism; de kallas endogena faktorer.
Utvecklingen av endo-skolans riktning är förknippad med den japanska vetenskapsmannen Tokuzo Endos vetenskapliga arbeten. Skolan representerades av så kända biologer som Tuzou Oshima (1904-1983) och Kaori Ito (född 1891). Studenter på Endo-skolan inkluderade till exempel sådana framstående specialister inom mikrobiologi som Norisato Masamune, Hideki Tokiwa och Tsutomu Kudo. Traditionen fortsätter idag i samband med studiet av kikhosta (kallad endo-kollektion); Skolans arbete påverkade utvecklingen av virologi och är av intresse i den historiska kontexten av kampen mot antibiotikaresistens och ekofarmakologi.