Endo er en japansk skole for bakteriologi, en retning inden for mikrobiologi. Navnet er givet til ære for den japanske bakteriolog Tohtaro Endo (1868-1952), skaberen af Endo-mediet til dyrkning af mikroorganismer. Udtrykket "endo-" bruges også til at beskrive visse egenskaber ved mikroorganismer, der inducerer væksten af en organisme; de kaldes endogene faktorer.
Udviklingen af endo-skoleretningen er forbundet med den japanske videnskabsmand Tokuzo Endos videnskabelige værker. Skolen var repræsenteret af så berømte biologer som Tuzou Oshima (1904-1983) og Kaori Ito (født 1891). Studerende på Endo-skolen inkluderede for eksempel sådanne fremtrædende specialister inden for mikrobiologi som Norisato Masamune, Hideki Tokiwa og Tsutomu Kudo. Traditionen fortsætter i dag i forbindelse med studiet af kighoste (kaldet endo-kollektion); Skolens arbejde har påvirket udviklingen af virologi og er af interesse i den historiske kontekst af kampen mod antibiotikaresistens og økofarmakologi.