Endo er en japansk skole for bakteriologi, en retning innen mikrobiologi. Navnet er gitt til ære for den japanske bakteriologen Tohtaro Endo (1868-1952), skaperen av Endo-mediet for dyrking av mikroorganismer. Begrepet "endo-" brukes også for å beskrive visse egenskaper til mikroorganismer som induserer veksten av en organisme; de kalles endogene faktorer.
Utviklingen av endo-skoleretningen er assosiert med de vitenskapelige arbeidene til den japanske forskeren Tokuzo Endo. Skolen var representert av så kjente biologer som Tuzou Oshima (1904-1983) og Kaori Ito (født 1891). Studenter ved Endo-skolen inkluderte for eksempel slike fremtredende spesialister innen mikrobiologi som Norisato Masamune, Hideki Tokiwa og Tsutomu Kudo. Tradisjonen fortsetter i dag i forbindelse med studiet av kikhoste (kalt endo-samling); Skolens arbeid påvirket utviklingen av virologi og er av interesse i den historiske konteksten av kampen mot antibiotikaresistens og økofarmakologi.