Kromozom matrisi, hücrenin genetik bilginin depolanmasından ve hücreler arasındaki aktarımının düzenlenmesinden sorumlu olan bölgesidir. Bu önemli bir yapıdır çünkü DNA replikasyon sürecinin, yani ana DNA molekülünden aynı bölgenin tam bir kopyasının yaratılmasının gerçekleştiği yerdir. Ek olarak matris, DNA'nın RNA'ya ve ardından proteinlere dönüştürüldüğü ve hücrenin işlevini yerine getirmesine izin veren bir süreç olan gen transkripsiyonunu da düzenler.
Kromozom matrisi, DNA çevresinde bir matris oluşturan DNA histonları ve DNA inhibitörleri dahil olmak üzere birçok biyolojik yapıdan oluşur. Ayrıca tüm genetik bilginin doğru bir şekilde kopyalanmasını sağlamak için gerekli olan replikatif enzimler ve translasyon proteinleri gibi çeşitli enzimleri de içerir. Onu dış etkenlerden koruyan ve kromozomal bileşenlerin göçünü önleyen bir nükleer zarla çevrilidir.
Ancak kanser veya kalıtsal hastalıklar gibi çeşitli hücresel hastalıklarda da kromozom matrisleri bozulabilir. Matrislerdeki bu bozulmalar genlerde mutasyonlara, DNA onarımının bozulmasına ve transkripsiyonda değişikliklere yol açabilir. Matriks-kromozom prion bozukluklarının bozulmuş fonksiyonları nörolojik hastalıkların gelişmesine yol açabilir.