Oplevelsen af fantomfornemmelser indikerer neuronal dysfunktion på det sted, hvor kropsdelen er tabt. Selve tilstedeværelsen af sådanne fornemmelser er en afspejling af den indledende ydeevne af nervefibre og celler men det faktum, at signalet fra hjernen vil blive transmitteret i en bestemt retning gennem det, er allerede resultatet af læring og arbejde med dannelsen af vanemæssige reaktioner