Autochthon (aus dem Griechischen autochthon – lokal) ist ein Begriff, der die indigenen Völker oder Pflanzen- und Tierarten beschreibt, die ursprünglich in einem Gebiet lebten.
Autochthone Völker sind jene Völker, die ursprünglich in einem bestimmten Gebiet lebten und dessen ursprüngliche Bewohner sind. Beispielsweise gelten die Indianer in Amerika als autochthone Bevölkerung, da sie lange vor der Ankunft der Europäer in diesem Gebiet lebten.
In der Biologie bezieht sich der Begriff „autochthon“ auf Pflanzen- und Tierarten, die sich auf natürliche Weise in einer bestimmten Region entwickelt haben. Autochthone Arten sind Teil lokaler Ökosysteme und spielen eine wichtige Rolle bei der Aufrechterhaltung ihrer Integrität und ihres Gleichgewichts. Beispielsweise gilt der Braunbär als autochthone Art der Taiga, da er an die Bedingungen dieses Lebensraums angepasst ist.
Somit betont der Begriff „autochthon“ die Verbindung von Völkern, Pflanzen und Tieren mit einem bestimmten Territorium, ihrer indigenen Herkunft und ihrer Zugehörigkeit zu lokalen Ökosystemen. Autochthonie ist wichtig für die Erhaltung der Artenvielfalt und des kulturellen Erbes.