Οι γενετικοί χάρτες είναι διαγράμματα που δείχνουν όλα τα γονίδια που βρίσκονται στο γονιδίωμα ενός δεδομένου οργανισμού, υποδεικνύοντας την αλληλουχία και τα μεγέθη τμημάτων τους. Συνήθως, ένας χάρτης γονιδίων κατασκευάζεται για έναν συγκεκριμένο τύπο οργανισμού σε σχέση με τους πλησιέστερους συγγενείς ή τους άγριους τύπους του. Ένας γενετικός χάρτης μπορεί επίσης να κατασκευαστεί για ενδοειδικά είδη προκειμένου να ανιχνευθεί ο υβριδισμός