Geneettiset kartat ovat kaavioita, jotka esittävät kaikki tietyn organismin genomissa olevat geenit ja osoittavat niiden sekvenssin ja segmentin koon. Tyypillisesti geenikartta rakennetaan tietylle organismityypille suhteessa sen lähimpiin sukulaisiin tai villityyppeihin. Myös lajinsisäisille lajeille voidaan rakentaa geneettinen kartta hybridisaation havaitsemiseksi