Μεταξύ όλων των πιθανών επιλογών για την κοπή του νεφρού, η χειρουργική επέμβαση περιλαμβάνει την ανατομή του. Η επέμβαση ανήκει στην κατηγορία της ανοιχτής παρέμβασης, γίνεται με γενική αναισθησία και το όργανο στα χέρια του χειρουργού αντιπροσωπεύεται από διάφορα πριόνια και λεπίδες, ανάλογα με τη συγκεκριμένη κλινική κατάσταση.
Υπάρχουν διάφοροι λόγοι για τους οποίους γίνεται εγκάρσια νεφροτομή στο νεφρό: νεφρική πέτρα, υδρονέφρωση, απόφραξη του ουροποιητικού συστήματος, τραυματισμοί στα οπισθοπεριτοναϊκά όργανα. Η μέθοδος είναι εξαιρετικά τραυματική, αλλά σώζει τη ζωή ενός ατόμου και χρησιμοποιείται συχνά για αμφοτερόπλευρες παθολογίες.