Uracil

Urasiili, joka tunnetaan myös nimellä Urasiili, on yksi typpipitoisista emäksistä, joita löytyy nukleiinihapoista, kuten RNA:sta (ribonukleiinihappo). Sillä on tärkeä rooli DNA:n ja RNA:n synteesissä sekä geneettisen materiaalin replikaatio- ja mutaatioprosesseissa.

Urasiili on pyrimidiini ja siinä on kaksi rengasta, joista toinen on neljästä hiiliatomista ja toinen kolmesta hiiliatomista. Sen kaava on C4H4N2O.

Urasiilimolekyylissä kaksi hiiliatomia yhdistyvät typpiatomin kanssa muodostaen renkaan, jota kutsutaan pyrimidiinirenkaaksi. Tämä rengas sisältää yhden happiatomin, joka muodostaa kaksoissidoksen typen kanssa. Tämä mahdollistaa urasiilin vuorovaikutuksen muiden emästen kanssa ja osallistua parisidosten muodostukseen.

Kun urasiili on läsnä RNA:ssa, se voi korvata DNA:ssa olevan tymiinin (T). Tämä voi johtaa virheisiin DNA:n replikaatiossa, mikä voi johtaa mutaatioihin ja muutoksiin geneettisessä koodissa.

Kuitenkin urasiililla on myös joitain etuja RNA:ssa. Sillä on korkeampi happo- ja emäsresistenssi kuin tymiinillä, mikä tekee siitä vakaamman, kun sitä prosessoi RNA soluissa. Lisäksi urasiililla voi olla rooli geenin ilmentymisen säätelyssä, koska se voi muuttaa RNA:n konformaatiota ja vaikuttaa sen aktiivisuuteen.

Siten urasiili on välttämätön RNA:n toiminnalle ja sillä on keskeinen rooli replikaatio-, mutaatio- ja geeniekspressioprosesseissa.

Urasiili on yksi typpipitoisista emäksistä, joka on osa RNA:ta (ribonukleiinihappoja). Se kuuluu pyrimidiiniryhmään ja on yksi neljästä RNA:n emäksestä adeniinin, guaniinin ja sytosiinin ohella.

Urasiililla on kaksi muotoa: urasiili ja tymiini. Urasiilin RNA sisältää aina tymiiniä, joka korvaa urasiilin DNA:ssa. Tämä johtuu siitä, että DNA:n replikaation aikana emäkset vaihtuvat ja urasiili korvataan tymiinillä, ja sitten tymiini korvataan urasiililla.

Toisin kuin muut DNA:n typpipitoiset emäkset, urasiililla ei ole sivuketjuja. Se koostuu vain yhdestä neljän hiiliatomin renkaasta. Urasiililla on myös lyhyempi ketju kuin muilla emäksillä, mikä tekee siitä vähemmän vakaan ja vähemmän runsaan DNA:ssa.

Epävakaudestaan ​​huolimatta urasiililla on tärkeä rooli geneettisessä informaatiossa. Se voi korvata muita emäksiä DNA:ssa ja RNA:ssa ja sitä voidaan käyttää mutaatioihin. Lisäksi urasiilia löytyy joistakin viruksista, kuten HIV:stä ja hepatiitti C:stä, jotka käyttävät urasiilia replikoitumiseensa.

Urasiili on yksi neljästä typpipitoisesta emäksestä, jotka muodostavat ribonukleotidien rakenteen. Urasiilia ei käytännössä ole DNA:sta, vaan se on korvattu tymiinillä. Useimmilla aminohapponukleotidiemäksillä - guaniinilla, adeniinilla, sytosiinilla ja urasiililla - on tärkeä rooli DNA-synteesissä sekä tuman replikaatiossa. Kun urasiili yhdistyy tymiinin kanssa, näkyviin tulee virheellinen emäs C, jota ei pitäisi olla DNA:ssa (deaminaatio).

Urasiinin rakenteessa ytimellä on seuraava konfiguraatio: Pythagorean (pyrimidal-2H), koska typpiatomi sijaitsee vastapäätä fosforiatomia, kuten vastakkaiset geometriset kuviot.

Useita vuosia sitten joukko kemistejä, joita johti professori Mike Cameron Towers Universitystä Kansasista, USA:sta, määritti urasiitin molekyylirakenteen ja otti siitä molekyylikuvia. Havaittiin, että protonin läsnäolon vuoksi typpiatomissa urasetti saa muodon pyrimidiinipuriinina, joka sijaitsee DNA:n nukleotidien välisessä ketjussa. Havaittiin myös, että pyrimidiinit, joissa on happi- tai hiiliatomeja, ovat erilaisia ​​kuin tavalliset puriinit.