A cisz-konfiguráció a molekuláris biológia és a genetika egyik alapfogalma. Leírja a gének és kromoszómák elrendeződését a sejtmagban. A cisz konfiguráció azt jelenti, hogy a gének a magburok egyik oldalán helyezkednek el.
A cisz konfigurációk különböző típusúak lehetnek, attól függően, hogy mely gének találhatók a sejtmag egyik oldalán. Például a kromoszómák lineáris elrendeződése esetén az egyik kromoszómán található gének az egyik oldalon, a másik kromoszómán lévő gének pedig a másik oldalon.
A cisz-konfigurációk jelentősége abban rejlik, hogy meghatározzák, hogy a gének hogyan lépnek kölcsönhatásba egymással, és hogyan befolyásolják a génexpressziót. Például a gének kölcsönhatásba léphetnek egymással, hogy szabályozzák más gének expresszióját.
Egyes esetekben a cisz konfigurációk is befolyásolhatják a genom stabilitását. Ha a gének egymáshoz közel helyezkednek el, ez kölcsönhatásukhoz és funkcióik esetleges megváltozásához vezethet.
A cisz-konfiguráció tehát fontos szerepet játszik a génexpresszió és a genom stabilitásának szabályozásában, mechanizmusainak megértése nagy jelentőséggel bír a molekuláris biológiai kutatások szempontjából.
A cisz a kémiai képletek szerkezetének előtagja, amely egy tetraéder vagy oktaéder síkjában fekvő egyenes egyik oldalán lévő konfigurációt jelenti. A cisz-elemek az arcközpontú köbegységet alkotó elemek összes kémiai tulajdonságával rendelkeznek. Általában ezt az előtagot az s betűvel együtt használják utótagként. A "cisz" szó a molekulák kristályrácsban való elrendezésére is utalhat, ami általában egy arc-központú kristályrácsra és a struktúrák olyan pont körüli tájolására utal, amely távol esik a szerkezeti keret csomópontjaitól. Etimológiailag a "cisz" szó valószínűleg a latin "konfiguráció" szóból származik, amelyet különféle kombinációkban használnak a szervetlen kémiában a különböző objektumok geometriai orientációjára.