Az agy három részből áll (félteke, kisagy és agytörzs), amelyek agypályákon keresztül kapcsolódnak egymáshoz. Az agy egyértelmű elképzeléséhez külön-külön meg kell vizsgálni az egyes szakaszok szerkezetét.
Szerkezetében az agy nem egyetlen entitás. Ezek számos idegsejt, úgynevezett neuronok gyűjteményei. Nagyon sok kapcsolatuk van egymással, folyamatokat - idegeket - képeznek. Nekik köszönhetően a gerjesztés neuronról neuronra továbbítódik