Gen kecil adalah serangkaian gen tertentu pada kromosom yang mempengaruhi gen yang terletak dalam satu sel. Keuntungan utama gen kecil adalah singkatnya, yang menjamin pengkodean informasi sederhana dan stabilitas penyimpanan. Mereka biasanya mewakili satu unit kode genetik yang independen secara fungsional dan mungkin mencakup banyak gen yang diketahui. Selain itu, gen kecil dapat diintegrasikan atau diwariskan dari sumber lain ke dalam sel. Fungsinya adalah untuk menyandikan dan mengatur proses genetik.
Misalnya, gen mitokondria, yang hanya digunakan di dalam sel, adalah contoh gen kecil. Ia melakukan fungsi biologis tertentu dan berisi informasi spesifik yang diperlukan agar reaksi biokimia tertentu terjadi selama respirasi sel. Gen kecil adalah unit independen dari genom yang lebih besar seperti kromosom. Ini biasanya mengkodekan mikroRNA, RNA nonkode panjang, atau molekul RNA kecil lainnya yang menjalankan fungsi spesifik di luar konstruksinya.
Fungsi gen skala kecil kurang dipahami, tetapi mereka memainkan peran penting dalam pengaturan proses seluler dan perkembangan organisme. Gen kecil sangat berguna untuk membuat sel rekombinan dan vaksin.