La coniugazione è una forma di processo sessuale in cui due cellule si uniscono temporaneamente e si scambiano materiale nucleare. La coniugazione è osservata in molti ciliati e in alcuni batteri.
La coniugazione è anche intesa come sinapsi cromosomica, uno stadio della meiosi durante il quale i cromosomi omologhi si uniscono e formano bivalenti. Durante la coniugazione vengono scambiate sezioni di cromosomi omologhi.
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