Конюгацията е форма на полов процес, при който две клетки временно се свързват и обменят ядрен материал. Конюгация се наблюдава при много реснички и някои бактерии.
Конюгацията също се разбира като хромозомен синапсис, етап на мейоза, по време на който хомоложните хромозоми се събират и образуват бивалентни. По време на конюгацията се разменят участъци от хомоложни хромозоми.