Obligate aerober er en gruppe mikroorganismer som er i stand til å leve og vokse i et oksygen-luftmiljø. De er hoveddeltakerne i biologiske prosesser som skjer i luften og spiller en viktig rolle i økosystemene.
Hovedforskjellen mellom obligatoriske aerober og fakultative og strenge anaerober er behovet for at deres vitale aktivitet krever tilstedeværelse av oksygen i miljøet. Dette er fordi de fleste obligate aerober (bakterier, mykoplasmaer, de fleste alger og andre mikroskopiske organismer) krever oksygen for respirasjon så vel som for oksidasjon av næringsstoffer de bruker for vekst og reproduksjon.
Obligate aerober inkluderer mange kjente bakterier (for eksempel Bacillus subtilis, Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa), så vel som mycoplasmas (Mycoplasma pneumoniae, M. genitalium, M. hominis) og noen sopp (Rhizopus nigricans, Asperslangillus). Noen av dem er patogener hos mennesker og dyr, forårsaker infeksjonssykdommer (Bacillus anthracis, Staphyloccocus aureus) eller allergier (Mycoplasma-superinfeksjoner).
Et obligatorisk anaerobt habitat betyr at obligate aerober blir tvunget til å tilpasse seg lave oksygennivåer og søke andre energikilder, for eksempel oksiderende sukker gjennom respiratoriske enzymer (det samme gjør de mer varierte anaerobe bakteriene). Aerobe organismer har spesialiserte oksygenopptaksmekanismer for å opprettholde en optimal respirasjonssyklus for å gi oksygen til pusten.
Selv om de fleste obligate aerobakterier er sykdomsassosierte mikroorganismer, kan noen også være gunstige for mennesker, for eksempel i matproduksjon (Lactobacillus acidophilus, Bifidobacterium lactis) eller avløpsvannbehandling (Schwanniomyces occidentalis) ved å bevare respirasjonen