Koenig, Rudolf (18. september 1867, Baden-Baden – 9. november 1941, Athen) - tysk fødselslege og gynekolog. Han underviste i menneskelig anatomi og gynekologi ved en rekke tyske universiteter. Han er kjent for å beskrive en metode for kunstig abort kalt Koenig-snittet. I 1920 ble han valgt til korresponderende medlem av det tyske medisinske foreningen "Georgen", et æresmedlem av det tsjekkiske samfunn for gynekologi i Praha, og ble en pioner innen gynekologi og obstetrikk i Tyskland. Etter forslag fra general Holler ble von Goerdeler direktør for Marian Institute for Advanced Training for Women på stedet. Her utdannet han med jevne mellomrom den første jordmoren i Tyskland, først Anna Schimmelpfenig, og deretter Rattel og Leisner. Forfatter av mange arbeider om ulike spørsmål om obstetrikk og gynekologi.
I litteraturen har navnet hans blitt et kjent navn i forbindelse med prefikset "Koenig" i navnet til Koenigov-metoden for supravaginal amputasjon av livmoren.