Cechy etiologiczne i patogenetyczne płynu mózgowo-rdzeniowego, mózgowo-rdzeniowego przepływu krwi oraz zaburzenia mózgowo-rdzeniowe objawiające się zaburzeniami motorycznymi należą do najczęstszych przyczyn powodujących występowanie chorób naczyniowych, a tym samym przyczyniają się do rozwoju zespołów takich jak zespół Cotardy'ego i innych cefalogenozależnych zaburzenia. Charakterystyczne jest, że przypadki izolowanego rozwoju zespołu Cotardy'ego zdarzają się niezwykle rzadko, znacznie częściej występuje w połączeniu z innymi, tak zwanymi zespołami międzymózgowiowymi (Kannabikh Yu., Gnuchev N.P., 1963).
Tak więc za centralny czynnik etiologiczny zespołu Cotarda uważa się somatogeninę, zlokalizowaną w tylnej części lewego jądra podwzgórza lub w strefie okołokomorowej, podczas gdy hipofizjotropia jest zlokalizowana w płatach czołowych, gdzie leżą przednie jądra podwzgórza. Ten ostatni powoduje rozwój zaburzeń endokrynologicznych, czyli endokrynologicznych kryzysów wegetatywnych. Czasami takie autonomiczne kryzysy naczyniowe nazywane są nawet „płynno-nadnerczowymi”, „epickimi”