Pterygoidartären är en gren av den externa halspulsådern och förser den temporomandibulära regionen med blod, mastoidprocessen, temporalmuskeln, musklerna i tungan, svalget och struphuvudet. Hos vuxna ligger den i gropen av den steniga ingången och följer med håligheten i stenboet; hos barn är den något lägre. Den lämnar kanalen genom den gemensamma artärstammen tillsammans med nerven och slemhinnan. Den rörliga delen av tvärstången går in i den infratemporala fossan. Trunks a. pterygoidea anterio et posterus divergerar och förenas i en vinkel av ca 20° bakom underkäken i ansiktsartären.
Artären i pterygoidkanalen är involverad i blodtillförseln till flera viktiga anatomiska områden av huvudet, såsom den laterala delen av skallen, parotis, större palatin och mindre palatine håligheter, hyoidben, munhåla, orofarynx och eustachian rör.