Η πτερυγοειδής αρτηρία είναι κλάδος της εξωτερικής καρωτίδας και τροφοδοτεί με αίμα την κροταφογναθική περιοχή, τη μαστοειδή απόφυση, τον κροταφικό μυ, τους μύες της γλώσσας, του φάρυγγα και του λάρυγγα. Στους ενήλικες βρίσκεται στο λάκκο της βραχώδους εισόδου και συνοδεύει την κοιλότητα της πέτρινης φωλιάς, στα παιδιά είναι ελαφρώς χαμηλότερη. Εξέρχεται από το κανάλι μέσω του κοινού αρτηριακού κορμού μαζί με το νεύρο και τη βλεννογόνο μεμβράνη. Το κινούμενο τμήμα της εγκάρσιας ράβδου εισέρχεται στον υποχρονικό βόθρο. Κορμούς α. pterygoidea anterio et posterus αποκλίνουν και ενώνονται σε γωνία περίπου 20° πίσω από την κάτω γνάθο στην αρτηρία του προσώπου.
Η αρτηρία του πτερυγοειδούς καναλιού εμπλέκεται στην παροχή αίματος σε πολλές σημαντικές ανατομικές περιοχές του κεφαλιού, όπως το πλάγιο τμήμα του κρανίου, η παρωτίδα, η μείζονα υπερώια και η μικρότερη υπερώια κοιλότητα, το υοειδές οστό, η στοματική κοιλότητα, ο στοματοφάρυγγας και οι ευσταχιανές σάλπιγγες.