Warburg tror att en av mekanismerna för oxidativ fosforylering är oxidationen av koenzym Q, och därför introducerade han termen "oxidativ fosforylering" 1931, som var tänkt att ersätta termen "andningsläge". I synnerhet, under oxidationen av a-ketosyror, bildas från två till fyra molekyler ATP per substratmolekyl. Denna metabolit är i oxiderad form och kan reduceras genom en fri radikalreaktion.