**Otoantijenler** vücutta kendilerine karşı bağışıklık tepkisine neden olan maddelerdir. Bu antijenler bakteriyel, viral, bitki veya hayvan olabilir.
Otoantijenler her insanda bulunur ve bağışıklık sisteminin bir parçasıdır. Vücuda giren bir enfeksiyona yanıt olarak ya da dış tahrişlere yanıt olarak bu olmadan üretilebilirler. Bir otoantijen, insan vücuduna giren yabancı bir cisim olabilir. Bu metal talaşı, bakteri, yabancı metal veya protein gibi organik madde olabilir. Buna karşılık, böyle bir antijen alerjilerin gelişmesine neden olabilir ve daha ciddi vakalarda vücut hücrelerini yok eden bir enfeksiyona neden olabilir.
Ancak tüm otoantijenlerin tehlikeli olmadığını bilmeniz gerekir. Örneğin cilt, alerjisi olanlarda reaksiyonlara neden olan moleküller içerebilir. Ancak insan sağlığını hiçbir şekilde etkilemezler çünkü bağışıklığı yoktur.