Parafasiküler çekirdek (lat. nuclęus parafascicularis), hücre gruplarından oluşan hayvanların (arılar, kuşlar, kemirgenler, memeliler) merkezi sinir sisteminin özel bir yapısıdır. Çekirdek, her biri belirli işlevleri yerine getiren birkaç parçaya bölünebilme özelliğine sahiptir. Bu yapının asıl görevi çevreye tepki verme hızıdır. Bunun nedeni, duruma bağlı olarak bireysel çekirdek bölümlerinin açılıp kapatılabilmesidir. Böylece hayvan, dış ortamdaki değişikliklere hızlı ve etkili bir şekilde yanıt verebilir.
Vücudun normal işleyişi için çekirdeğin beslenmeye ve oksijene ihtiyacı vardır. Beyin bölgesinde, çeşitli tipteki nöronların toplandığı retinanın yakınında bulunur. Bu çekirdeğin gelişimi, pratik olarak herhangi bir tedavi olmaksızın göz zarlarının geliştiği aşamada gözlemlenebilir, çünkü ne bir çocuk ne de bir yetişkin, çeşitli fizyolojik süreçler ve dış etkiler sırasında çekirdeğin işleyişinde rahatsızlıklar yaşamaz. Bu durumda parafasiküler çekirdek çok önemli bir rol oynar.